商品批發企業增值稅進項稅額的會計核算，主要涉及“在途物資”、“庫存商品”、“應交稅費——應交增值稅(進項稅額)”等賬戶。購入商品在貨款結算時，按購買價格借記“在途物資”賬戶;按專用發票上注明的增值稅額，
借記“應交稅費——應交增值稅(進項稅額)”賬戶;按購買價格與應納增值稅額之和，貸記“應付賬款”、“應付票據”、“銀行存款”等賬戶;商品驗收入庫時，借記“庫存商品”賬戶，貸記“在途商品”賬戶。例：紅星商業批發公司1月份購入甲商品一批，取得的專用發票上注明的價款200000元，增值稅款34000元。另支付運雜費1200元(其中運費1000元，裝卸費200元)，已取得合法的運費結算單據。商品已驗收入庫，款項均以銀行轉賬支票付訖。則其會計處理如下：
支付貨款時：
借：在途物資 200000
應交稅費——應交增值稅(進項稅額) 34000
貸：銀行存款 234000
支付運雜費時：
借：在途物資 1130
應交稅費——應交增值稅(進項稅額) 70
貸：銀行存款 1200
商品驗收入庫時：
借：庫存商品——甲商品 201130
貸：在途物資 201130(200000+1130)。
