古為邳國(guó)。戰(zhàn)國(guó)時(shí)為齊邳邑。秦置下邳縣。漢置下邳國(guó)、下邳郡和徐州刺史部。北周改下邳郡為邳州。故治在今睢寧縣古邳鎮(zhèn)。元時(shí)全國(guó)省縣入州，因邳州駐下邳縣，遂廢下邳縣入邳州，境由州轄。清初郯城大地震，故治毀，州治移今市北邳城。1912年全國(guó)廢州復(fù)縣，邳州改為邳縣。1992年邳縣撤縣建市成立邳州市。
上古奚仲建邳國(guó)，邳國(guó)被彭國(guó)擊敗后，徐國(guó)疆域由邳州東北部擴(kuò)展至邳州全境。徐國(guó)鼎盛時(shí)建都于今戴莊鎮(zhèn)境內(nèi)。徐國(guó)被周擊敗后一蹶不振，最終被吳國(guó)攻滅。后為齊國(guó)屬地，鄒忌曾被封于此。秦朝為東?？は纶h。漢時(shí)為下邳國(guó)，后為下邳郡，并成為徐州刺史部駐地。三國(guó)時(shí)期為徐州刺史部下邳郡。西晉時(shí)為下邳國(guó)。北魏時(shí)為徐州下邳郡。北周改下邳郡為邳州。隋朝恢復(fù)邳州為下邳郡。唐朝為泗州下邳縣。北宋時(shí)期為京東東路淮陽(yáng)軍下邳縣。金朝時(shí)為山東西路邳州，金末為山東治。元朝時(shí)期屬于河南江北行省的歸德府邳州。明朝時(shí)為南直隸淮安府邳州。清朝初期為江蘇省邳州，沉舊州后為江蘇省徐州府邳州。中華民國(guó)（1912年）元年廢邳州改置邳縣。1948年屬于江蘇省第九行政署察區(qū)。1949－1953年屬于山東省。1992年7月7日，國(guó)務(wù)院、民政部批準(zhǔn)邳縣撤縣建市設(shè)立江蘇省轄縣級(jí)邳州市，江蘇省委托徐州市代管邳州市。
今邳州境內(nèi)出生的歷史名人數(shù)不勝數(shù)。明代琵琶演奏家湯應(yīng)曾技藝絕倫，譽(yù)滿天下。民國(guó)劉仁航著述30多部，被譽(yù)為“北方學(xué)者”。新中國(guó)成立以后，地方文化獲得較快發(fā)展，以農(nóng)民畫(huà)、民間剪紙為代表的民間藝術(shù)，以獨(dú)特的藝術(shù)手法，生動(dòng)形象地反映了農(nóng)民的生產(chǎn)生活，有一定的思想性和藝術(shù)性。
邳州位于交通要沖，到后來(lái)作為隴海鐵路與京杭大運(yùn)河的交點(diǎn)，因此成為兵家必爭(zhēng)之地。在歷史上，邳州經(jīng)歷了楚漢相爭(zhēng)、三國(guó)角逐、宋金交兵等大規(guī)模戰(zhàn)爭(zhēng)?？谷諔?zhàn)爭(zhēng)中的徐州會(huì)戰(zhàn)，包括1938年的臺(tái)兒莊戰(zhàn)役，即在此發(fā)生過(guò)。與臺(tái)兒莊接壤的邳縣燕子埠鄉(xiāng)的民眾積極支前，周邊多個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)都協(xié)助中國(guó)軍隊(duì)建立兵站、支援前線、救助傷員。國(guó)共內(nèi)戰(zhàn)中淮海戰(zhàn)役時(shí)，國(guó)共兩軍亦曾鏖戰(zhàn)與此。戰(zhàn)爭(zhēng)中，新四軍蘇北支隊(duì)也以邳縣北部與山東南部微山湖一帶為根據(jù)地。出生于邳州的中國(guó)同盟會(huì)員徐國(guó)泰追隨黃興參加廣州黃花崗起義，獻(xiàn)身于黃花崗，為黃花崗七十二烈士之一。著名文學(xué)作品《紅巖》中的“小蘿卜頭”宋振中及其父母宋綺云、徐林俠夫婦等許多革命先烈皆為邳州人。
邳州地處北緯34度附近，位于蘇、魯、豫、皖接壤地區(qū)以及江蘇省確定的徐州連云港都市圈中部，幅員面積2,088平方公里。市區(qū)坐落在東隴海鐵路與京杭大運(yùn)河的交匯處，是蘇北、魯南水陸交通樞紐。邳州位于黃淮海平原，黃河古道曾穿境而過(guò)，現(xiàn)如今京杭大運(yùn)河貫穿境內(nèi)，北望微山湖，南接駱馬湖，隔京杭大運(yùn)河與山東省棗莊市臺(tái)兒莊區(qū)接壤。
邳州屬暖溫帶半濕潤(rùn)季風(fēng)氣候，四季分明，季風(fēng)顯著，光照和雨量充足，歷年以來(lái)年平均氣溫約14℃，年平均降水量800毫米以上，年平均日照時(shí)數(shù)約為2,300小時(shí)。豐富的氣候資源有利于工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。由于暫時(shí)無(wú)法獲得邳州市氣象記錄的歷史資料，這里暫時(shí)使用徐州市近五十年來(lái)的氣象信息，不過(guò)兩地相距不超過(guò)100公里，因此這里給出的氣象信息基本代表了邳州本地的氣候狀況。
邳州市現(xiàn)轄21個(gè)鎮(zhèn)、4個(gè)街道辦事處488個(gè)行政村（居）。另外，邳州經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)（省級(jí)開(kāi)發(fā)區(qū)）為邳州市設(shè)立的經(jīng)濟(jì)管理區(qū)，副縣處級(jí)單位，下轄戴圩街道辦事處部分行政村（居）。
運(yùn)河街道、?炮車街道、?戴圩街道、?東湖街道、?邳城鎮(zhèn)、?官湖鎮(zhèn)、?四戶鎮(zhèn)、?宿羊山鎮(zhèn)、?八義集鎮(zhèn)、?土山鎮(zhèn)、?碾莊鎮(zhèn)、?港上鎮(zhèn)、?鄒莊鎮(zhèn)、?占城鎮(zhèn)、?新河鎮(zhèn)、?八路鎮(zhèn)、?鐵富鎮(zhèn)、?岔河鎮(zhèn)、?陳樓鎮(zhèn)、?邢樓鎮(zhèn)、?戴莊鎮(zhèn)、?車輻山鎮(zhèn)、?燕子埠鎮(zhèn)、?趙墩鎮(zhèn)、?議堂鎮(zhèn)、?邳城農(nóng)場(chǎng)和張樓農(nóng)場(chǎng)。
根據(jù)第七次全國(guó)人口普查顯示邳州市常住人口為1462563人。
2014年，邳州完成地區(qū)生產(chǎn)總值完成684.48億元，增長(zhǎng)11.7%。其中，第一產(chǎn)業(yè)增加值95.81億元，增長(zhǎng)2.8%；第二產(chǎn)業(yè)增加值294.59億元，增長(zhǎng)13.2%；第三產(chǎn)業(yè)增加值294.08億元，增長(zhǎng)12.7%。人均地區(qū)生產(chǎn)總值達(dá)到47,761元，比上年增加5,157元，增長(zhǎng)12.1%。邳州一般公共預(yù)算收入55.6億元，增長(zhǎng)13.7%，稅收占比達(dá)85%；城鄉(xiāng)居民收入分別達(dá)24,675元、14,088元，增長(zhǎng)9.8%和11.5%；蟬聯(lián)中國(guó)中小城市綜合實(shí)力百?gòu)?qiáng)、最具投資潛力百?gòu)?qiáng)，2014年，邳州在全國(guó)百?gòu)?qiáng)縣位居第46位 ，競(jìng)爭(zhēng)力等級(jí)為A+級(jí)。
2014年，邳州三次產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)為14.0：43.0：43.0，第三產(chǎn)業(yè)占比比上年提高0.5個(gè)百分點(diǎn)。全年規(guī)模以上工業(yè)實(shí)現(xiàn)高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)產(chǎn)值704.99億元，比上年增加86.73億元，增長(zhǎng)14.0%，占規(guī)模以上工業(yè)產(chǎn)值比重為33.6%，比上年提高1個(gè)百分點(diǎn)；新興產(chǎn)業(yè)產(chǎn)值實(shí)現(xiàn)699.83億元，比上年增加86.44億元，增長(zhǎng)14.1%。2014年，邳州服務(wù)業(yè)增加值增長(zhǎng)12.3%；實(shí)現(xiàn)社會(huì)消費(fèi)品零售總額147.9億元，增長(zhǎng)13.5%。開(kāi)工現(xiàn)代服務(wù)業(yè)重大項(xiàng)目22個(gè)，大學(xué)生創(chuàng)業(yè)園、環(huán)球新天地商業(yè)街等7個(gè)項(xiàng)目建成使用，新城區(qū)“中心商圈”逐步形成。歡樂(lè)買商貿(mào)入選商務(wù)部“萬(wàn)村千鄉(xiāng)”市場(chǎng)工程企業(yè)。
文學(xué)作品中，有一種說(shuō)法說(shuō)《白毛女》的故事原型也發(fā)生在邳縣。其作者賀敬之就是燕子埠鄉(xiāng)賀集村人。燕子埠鄉(xiāng)治所在有一前山，山上面仍然有古廟和洞穴，以及罕見(jiàn)的石洞中的水井。當(dāng)?shù)厝朔Q該廟為奶奶廟，白毛女的傳說(shuō)即發(fā)生與此，賀敬之即根據(jù)傳說(shuō)寫(xiě)就白毛女，文學(xué)作品中的白毛女最終得救，比歷史和現(xiàn)實(shí)中的白毛女與奶奶廟都幸運(yùn)多了。傳說(shuō)中奶奶廟古已有之，周圍仍有許多清代文人墨客所留的石碑。然而，因?yàn)樵搹R所在的山石料非常適合作水泥，當(dāng)?shù)厝撕蛠?lái)自浙江的商人正在肆意開(kāi)采山石，奶奶廟已然岌岌可危。
柳琴戲?yàn)楫?dāng)?shù)刂耖g曲藝，類似京西大鼓，中華人民共和國(guó)成立前及初期頗為流行。
邳州市景點(diǎn)包括京杭大運(yùn)河、艾山九龍風(fēng)景區(qū)、土山古鎮(zhèn)景區(qū)關(guān)帝廟、邳州國(guó)家銀杏博覽園、沙溝湖生態(tài)示范園、淮海戰(zhàn)役碾莊圩戰(zhàn)斗紀(jì)念館、大墩子遺址等。
邳州市擁有世界上最長(zhǎng)的水杉景觀大道。這個(gè)大道大概有60公里長(zhǎng)，主要部分是連接邳州市和蒼山縣的邳蒼公路（40公里）。道路兩旁種滿了水杉樹(shù)，大約有100萬(wàn)株。
邳州現(xiàn)有各類學(xué)校288所，其中小學(xué)233所，初中35所，高中11所，省四星級(jí)中等專業(yè)學(xué)校2所，特殊教育學(xué)校3所，民辦學(xué)校4所，在校學(xué)生242021人。公辦幼兒園49所?，F(xiàn)有教職工14096人。
當(dāng)?shù)厝颂貏e注重教育，往往以質(zhì)樸勤奮，取得非常優(yōu)秀的成績(jī)。運(yùn)河中學(xué)是江蘇省重點(diǎn)中學(xué)之一。目前邳州市共有江蘇省省級(jí)重點(diǎn)中學(xué)四所，分別是：邳州市運(yùn)河中學(xué)（1994年通過(guò)）、邳州市宿羊山中學(xué)（1998年通過(guò)）、邳州市官湖中學(xué)（1999年通過(guò)）、邳州市八義集中學(xué)（2000年通過(guò)）。
2007年10月，全市各個(gè)工作崗位人員迎接剛剛參加中共十七大“凱旋”的代表、邳州市委書(shū)記李連玉，場(chǎng)面宏大、極其夸張，遭到公眾非議。2017年8月，李連玉因?yàn)闉E用職權(quán)、受賄案，被判處有期徒刑八年，并處罰金人民幣三十萬(wàn)元。
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