根據《國家稅務總局關于被盜、丟失增值稅專用發票的處理意見的通知》(國稅函〔1995〕292號)規定：
一、納稅人必須嚴格按《增值稅專用發票使用規定》保管使用專用發票，對違反規定發生被盜、丟失專用發票的納稅人，主管稅務機關必須嚴格按《中華人民共和國稅收征收管理法》和《中華人民共和國發票管理辦法》的規定，處以1萬元以下的罰款，并可視具體情況，對丟失專用發票的納稅人，在一定期限內(最長不超過半年)停止領購專用發票。對納稅人申報遺失的專用發票，如發現非法代開、虛開問題的，該納稅人應承擔偷稅、騙稅的連帶責任。
二、為便于各地稅務機關、納稅人對照查找被盜、丟失的專用發票，減輕各地稅務機關相互之間傳(寄)專用發票遺失通報的工作量，對發生被盜、丟失專用發票的納稅人，必須要求統一在《中國稅務報》上刊登“遺失聲明”。
三、納稅人丟失專用發票后，必須按規定程序向當地主管稅務機關、公安機關報失。各地稅務機關對丟失專用發票的納稅人按規定進行處罰的同時，代收取“掛失登報費”，并將丟失專用發票的納稅人名稱、發票份數、字軌號碼、蓋章與否等情況，統一傳(寄)中國稅務報社刊登“遺失聲明”。傳(寄)中國稅務報社的“遺失聲明”，必須經縣(市)國家稅務局審核蓋章、簽注意見。
根據《國家稅務總局關于簡化增值稅發票領用和使用程序有關問題的公告》(國家稅務總局公告2014年第19號)規定：三、簡化丟失專用發票的處理流程一般納稅人丟失已開具專用發票的發票聯和抵扣聯，如果丟失前已認證相符的，購買方可憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯復印件及銷售方主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》或《丟失貨物運輸業增值稅專用發票已報稅證明單》(附件1、2，以下統稱《證明單》)，作為增值稅進項稅額的抵扣憑證;如果丟失前未認證的，購買方憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯復印件進行認證，認證相符的可憑專用發票記賬聯復印件及銷售方主管稅務機關出具的《證明單》，作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。專用發票記賬聯復印件和《證明單》留存備查。
一般納稅人丟失已開具專用發票的抵扣聯，如果丟失前已認證相符的，可使用專用發票發票聯復印件留存備查;如果丟失前未認證的，可使用專用發票發票聯認證，專用發票發票聯復印件留存備查。
一般納稅人丟失已開具專用發票的發票聯，可將專用發票抵扣聯作為記賬憑證，專用發票抵扣聯復印件留存備查
